Tahun 2015 Masehi. Era terakhir di mana ilmu sihir masih berkembang pesat. Organisasi Keamanan Chaldea didirikan untuk fokus melestarikan kelanjutan sejarah manusia. Mereka mengamati dunia yang tidak dapat diamati oleh ilmu sihir dan sains tidak dapat mengukur semuanya untuk mencegah kepunahan umat manusia. Namun suatu hari, masa depan yang terus diamati Chaldea menghilang dan kepunahan umat manusia pada tahun 2017 menjadi jelas. Sebaliknya, itu sudah terjadi. Penyebabnya tampaknya terkait dengan Fuyuki, sebuah kota provinsi di Jepang, pada tahun 2004 Masehi. Di sana, “wilayah yang tidak dapat diamati” yang sebelumnya tidak ada muncul. Berdasarkan asumsi bahwa Fuyuki adalah alasan kepunahan umat manusia, Chaldea mengeluarkan perintah untuk menjelajahi, menyelidiki, dan mungkin menghancurkan singularitas ini – sebuah pencarian untuk Holy Grail, Grand Order.
